套期保值是以回避现货价格风险为目的的期货交易行为。要实现这一目的，通常要求投资者在期货市场买进或卖出与现货资产品种相同、数量相当、方向相反、月份相同的期货合约，从而在期货和现货两个市场之间建立盈亏对冲机制，进而规避现货价格波动风险。尽管套保目的是对冲风险，但是套保中的一些内在机制决定了套保本身也存在风险。
　　首先是基差风险。套保交易中，只有现货价格变动幅度和期货价格变动幅度完全相同，才会达到完美套期保值的目的。实际中，两个市场变动幅度完全相同的情况非常罕见。如果两个市场波动不完全相同，就会出现净盈利或净亏损的情况，这就是基差风险。基差的大小变化有“走强”和“走弱”两种。如果基差走强，买入套期保值者就会遭到亏损；如果基差走弱，卖出套期保值者就要遭受损失。
　　其次，交叉套保风险。品种相同是套期保值的一个基本原则，也就是说，所选择的期货品种必须与现货品种相同。只有品种相同，期货价格和现货价格之间才有可能形成密切的关系，价格走势才能趋同。股指期货交易的对象沪深300指数是特定的，无论投资者的现货股票组合构造的如何完美，都不可能与指数构成完全相同。所以，在股指期货套期保值中，通常采用“交叉套期保值”的方法，也就产生了“交叉套保”风险。
　　再者，数量风险。套期保值要求坚持数量相等原则，即所选用的期货合约数量必须和现货头寸相等。因为只有两个市场交易品种数量相等，才能使一个市场盈利额与另一个市场亏损额相等。我们知道，套期保值期货合约数=（现货资产价值/期货合约规模）×β系数。根据数量相等原则，股票现货在总额上必须能被期货合约整除。对于出现的除不尽情况，如果四舍五入，则会出现保值不足；如果向上进位，则又会保值有余。因而产生一定的差异就再说难免。
　　还有，模型风险。套期保值需要计算β系数，并假定现货股票组合严格按照β系数比例涨跌。然而现实中，这很难实现。尽管β系数的计算有普通最小二乘法、B-VAR模型、VECM模型以及ARCH模型等多种计算方法，但是不管哪种方法计算的β系数都是基于历史数据，其代表的是历史上该股票现货组合与沪深300指数的相互关系。历史不同于现实，投资者现货组合在未来时间的实际β系数与历史β系数之间必然会存在一定误差。如果实际β值大于历史β值，在上升行情中，买入套期保值者就会遭受损失；如果实际β值小于历史β值，在上升行情中，买入套期保值者则有盈利。对于卖出套期保值者来说，影响正好相反。
　　最后，成本风险。套期保值的成本主要包括三个方面：一是交易手续费；二是交易保证金；三是潜在资金需求。套保过程中，如果套保合约亏损达到一定程度，就必须追加保证金，否则所持合约头寸将被强行平仓，致使套期保值失败。即使是行情发展有利于期货合约持仓头寸，在资金安排上也要留有余地以备不时之需。这些成本因素的存在有可能完全抵消套保的收益。